La tipologia e la quantità dei singoli batteri variano a seconda del tratto dell’intestino: nell’intestino tenue, cioè nella parte iniziale dell’intestino, sono più presenti batteri aerobi, mentre nel crasso, ossia la parte finale, la quasi totalità dei batteri è anaerobia. Questo perché variano sia la quantità di ossigeno, che via via diminuisce, sia il pH, che diventa sempre più alcalino. Lo stomaco, invece, ha una popolazione batterica molto bassa. Ovviamente la flora batterica dipende anche dalla salute della persona, dalla sua alimentazione, dal suo stile di vita. C’è una particolare autoregolazione promossa dai batteri stessi, tramite la produzione di batteriocine (che agiscono contro i batteri della stessa specie) e antibiotici naturali (che agiscono contro le altre specie), così da rendere molto difficile la sopravvivenza di microrganismi patogeni.

I batteri sono dei microrganismi simbionti: dal nostro organismo traggono nutrimento e al nostro organismo apportano una lunga serie di vantaggi. Svolgono infatti varie funzioni: immunologiche (impediscono lo sviluppo di specie batteriche nocive, rimuovono scorie e microrganismi patogeni, rafforzano le difese immunitarie, in quanto le immunoglobuline si formano per lo più a livello intestinale), metaboliche (migliorano il transito digestivo, aiutano la digestione degli alimenti) e nutritive (sintetizzano vitamine quali la K e la B12, sono coinvolti nel metabolismo di acidi biliari e ormoni steroidei).

Questo equilibrio, tuttavia, è facilmente alterabile: cattiva alimentazione, ricca di farine e zuccheri raffinati e povera di frutta e verdura, assunzione prolungata di farmaci (antibiotici, estrogeni, lassativi), intossicazioni da metalli pesanti, così come stress fisici e psichici provocano un’alterazione della flora batterica, con conseguente cattiva digestione, colite, meteorismo, diarrea o stitichezza. Il cibo, infatti, non segue più un transito regolare, i batteri non metabolizzano i residui che così subiscono processi di fermentazione e putrefazione, con la formazione di varie sostanze tossiche (cadaverina, formaldeide, putrescina..), che molto spesso non riescono ad essere smaltite adeguatamente da fegato e reni, con conseguente intossicazione di tutto l’organismo. Si possono avere così sintomatologie o patologie non legate all’intestino: ansia, insonnia, stanchezza, problemi della pelle come le dermatiti, indebolimento generale delle difese immunitarie. La mancata azione di difesa esercitata dai batteri “buoni” può causare il sopravvento di microrganismi “cattivi”: ad esempio nel caso della candida, un fungo che normalmente è presente a livello intestinale e vaginale in forma di spore, ma che può trasformarsi nella forma vegetativa patogena, a causa di disbiosi, alimentazione scorretta, farmaci usati per periodi prolungati..

Per aiutare l’organismo nei periodi di maggior stress, di alimentazione non troppo corretta o di assunzione necessaria di farmaci come gli antibiotici si può ricorrere ad integratori di probiotici, cioè di batteri che arrivano vivi e attivi a livello intestinale, possibilmente con l’aggiunta di sostanze prebiotiche, che aiutano la proliferazione dei batteri stessi: sono sostanze, come l’inulina, che non vengono metabolizzate dal nostro organismo, arrivano così inalterate nell’intestino, e fungono da substrato per lo sviluppo dei batteri lì presenti.